真菌感染的实验室检查是包括直接镜检法和培养法、病理学方法、血清学方法和分子生物学方法等检查方法。

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真菌培养检查是对真菌进行培养并对真菌的菌属进行鉴定，进而对真菌感染引起的疾病进行针对性的治疗的方法。

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真菌组织病理学是深部真菌感染的重要诊断方法，组织中真菌的鉴定标志着病原学诊断水平。免疫组织化学根据真菌抗原性不同将真菌分类 。需要检查的人群是多引起角膜炎、泪小管炎等真菌感染症状的患者。

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真菌感染引起的疾病称为真菌病，发病率最高的念珠菌病和皮肤癣菌病由人体正常菌群的真菌引起， 感染可区分为：表面感染,皮肤感染，皮下组织感染，深部感染和条件性感染。

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在人类引起侵袭性感染的真菌一直被分为原发性致病菌和机会性致病菌。

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可诊断链球菌、葡萄球菌、炭疽杆菌、麻风杆菌、结核杆菌、各种真菌感染、阿米巴、黑热病、丝虫病、疥疮、螨虫等所致之皮肤病。

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真菌性角膜炎(fungal keratitis，mycotic keratitis)或角膜真菌病(keratomycosis)，临床上较难诊断，容易误诊，常因治疗不当而造成失明。

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外耳道真菌病（otomycosis externa）是外耳道的真菌感染性疾病。

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真菌性肠炎(fungal enteritis)是机体学问真菌病的重要类型之一。消化道是真菌侵入体内的主要传染途径，对健康和生命都有较大的威胁。

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真菌性角膜溃疡于1878年首先由Leber报导。以往由于发病率不高，文献上较少提及。50年代以后，国面值外报导逐渐增加。近10年来，本病在我国亦有明显的增多趋势。

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